BLAST یک الگوریتم کامپیوتری است که برای استفاده به صورت آنلاین در وب سایت مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) و همچنین بسیاری از سایت های دیگر در دسترس است. BLAST می تواند به سرعت یک توالی DNA پرس و جو را با پایگاه داده ای از توالی ها تراز و مقایسه کند، که آن را به ابزاری حیاتی در تحقیقات ژنومی در حال انجام تبدیل می کند.
آیا BLAST یک پایگاه داده اصلی است؟
BLAST پرکاربردترین نرم افزار در تحقیقات بیوانفورماتیک است. عملکرد اصلی آن مقایسه یک توالی مورد علاقه، دنباله پرس و جو، با دنباله های یک پایگاه داده بزرگ BLAST است و سپس بهترین تطابق ها، یا "Hits" یافت شده در پایگاه داده را گزارش می دهد. این برنامه ساده دو کاربرد اصلی دارد.
آیا NCBI یک پایگاه داده است؟
NCBI دارای یک سری از پایگاه های داده مرتبط با بیوتکنولوژی و زیست پزشکی است و منبع مهمی برای ابزارها و خدمات بیوانفورماتیک است.پایگاه های داده اصلی عبارتند از GenBank برای توالی های DNA و PubMed، پایگاه داده کتابشناختی برای ادبیات زیست پزشکی. سایر پایگاه های داده شامل پایگاه داده NCBI Epigenomics است.
آیا BLAST فقط در پایگاه های داده NCBI استفاده می شود؟
BLAST در وب در وب سایت NCBI موجود است. انواع مختلفی از BLAST ها با توجه به دنباله های پرس و جو و پایگاه های داده هدف در دسترس هستند.
پایگاه داده BLAST چگونه کار می کند؟
BLAST چگونه کار می کند؟ BLAST توالی های همولوگ را با استفاده از روش اکتشافی شناسایی می کند که در ابتدا تطابق کوتاه بین دو دنباله را پیدا می کند. بنابراین، روش کل فضای دنباله را در نظر نمی گیرد. پس از تطابق اولیه، BLAST تلاش می کند تا ترازهای محلی را از این مسابقات اولیه شروع کند.
