از دست دادن آنتروپی ساختاری سهم عمده ای در ترمودینامیک چین خوردگی پروتئین است با این حال، تعیین دقیق کمیت چالش برانگیز است. ما این تلفات را با استفاده از شبیه‌سازی دینامیک مولکولی پروتئین بومی و یک مجموعه حالت دناتوره‌شده واقعی محاسبه می‌کنیم.
پروتئین آنتروپی ساختاری چیست؟
آنتروپی ساختاری آنتروپی مرتبط با تعداد ترکیبات یک مولکول است. … در پروتئین ها، زوایای دو وجهی ستون فقرات و روتامرهای زنجیره جانبی معمولاً به عنوان پارامتر استفاده می شوند و در RNA ممکن است از الگوی جفت شدن پایه استفاده شود.
کدام یک پروتئین تا شده یا تا شده آنتروپی ساختاری بیشتری دارد؟
آنتروپی ساختاری زنجیره پلی پپتیدی برای حالت بازشده در مقایسه با حالت فشرده تر که با فضای ساختاری بسیار محدودتر مشخص می شود، بزرگتر است. بنابراین، این مشارکت حالت بازشده را تثبیت می‌کند (ΔSconf > 0).
چه چیزی ترکیب پروتئین را تعیین می کند و مشکل مرتبط با تا شدن پروتئین چیست؟
ساختار اولیه یک پروتئین، توالی اسید آمینه خطی آن ، ترکیب اصلی آن را تعیین می کند. بقایای اسید آمینه خاص و موقعیت آنها در زنجیره پلی پپتیدی عوامل تعیین کننده ای هستند که بخش هایی از پروتئین به هم نزدیک می شوند و ترکیب سه بعدی آن را تشکیل می دهند.
چه عواملی بر تاخوردگی پروتئین تأثیر می گذارد؟
تاکردن پروتئین یک فرآیند بسیار حساس است که تحت تأثیر چندین عامل خارجی از جمله میدان های الکتریکی و مغناطیسی، دما، pH، مواد شیمیایی، محدودیت فضا و ازدحام مولکولی است.این عوامل بر توانایی پروتئین ها برای تا شدن به اشکال عملکردی صحیح آنها تأثیر می گذارد.
