BigWig فرمت فایلی برای نمایش داده های متراکم و پیوسته در مسیر مرورگر ژنوم است که با تبدیل از فرمت Wiggle (WIG) ایجاد شده است. فرمت BigWig در وب سایت UCSC Genome Bioinformatics توضیح داده شده است و راهنمای قالب فایل موسسه Broad اطلاعات بیشتری را ارائه می دهد.
قالب bigWig چیست؟
قالب bigWig برای نمایش داده های متراکم و پیوسته است که به صورت نمودار نمایش داده می شود فایل های BigWig در ابتدا از فایل های نوع WIG با استفاده از برنامه UCSC wigToBigWig ایجاد می شوند. همچنین، فایل‌های bigWig را می‌توان از فایل‌های bedGraph با استفاده از برنامه UCSC bedGraphToBigWig ایجاد کرد.
چگونه از فایل bigWig استفاده کنم؟
فایل bigWig تازه ایجاد شده (myBigWig.bw) به یک مکان http، https، یا ftp قابل دسترسی تحت وب. URL را در فرم ورودی آهنگ سفارشی جای‌گذاری کنید یا با استفاده از یک خط آهنگ، یک مسیر سفارشی بسازید. خط آهنگ سفارشی را در کادر متنی در صفحه مدیریت آهنگ سفارشی جای‌گذاری کنید.
تراک bigWig چیست؟
bigWig Tracks مسیرهایی برای سیگنال‌های پیوسته در کل ژنوم هستند. آنها برای نمایش نتایج آزمایش های "خام" مختلف مانند سیگنال های ChIP-Seq، سیگنال های RNA-Seq و غیره مناسب هستند.
چگونه یک فایل bigWig ایجاد کنم؟
راه های متعددی برای تولید فایل های بزرگ وجود دارد. این معمولاً شامل تبدیل یک. فایل bam به یک آهنگ wiggle (. wig) و سپس تبدیل آهنگ wiggle به یک bigwig باینری (.
