SDS قویاً به باقیمانده های دارای بار مثبت و آبگریز پروتئین ها از طریق گروه های سولفات و زنجیره های آلکیل، به ترتیب ، به ترتیب 13 متصل می شود. این یک شوینده با ارزش در زمینه زیست شناسی ساختاری و مطالعات تاشو/باز شدن پروتئین است.
SDS با پروتئین چه می کند؟
SDS یک سورفکتانت آمفی پاتیک است. این پروتئین ها را با اتصال به زنجیره پروتئین با دنباله هیدروکربنی، دناتوره می کند، نواحی معمولی مدفون را در معرض دید قرار می دهد و زنجیره پروتئین را با مولکول های سورفکتانت می پوشاند. گروه سر قطبی SDS یک مزیت اضافی به استفاده از این دناتورانت اضافه می کند.
چگونه SDS به اسیدهای آمینه متصل می شود؟
SDS دارای دم آبگریز است که به شدت با زنجیره های پروتئینی (پلی پپتیدی) تعامل دارد.تعداد مولکول‌های SDS که به پروتئین متصل می‌شوند، متناسب با تعداد اسیدهای آمینه سازنده پروتئین است.
آیا SDS پروتئین ها را پوشش می دهد؟
SDS همچنین پروتئین را با یک بار منفی یکنواختمی پوشاند که بارهای ذاتی در گروه های R را می پوشاند. SDS به طور نسبتاً یکنواخت به پروتئین های خطی متصل می شود (حدود 1.4 گرم SDS / 1 گرم پروتئین)، به این معنی که بار پروتئین اکنون تقریباً با وزن مولکولی آن متناسب است.
چگونه SDS به پروتئین بار منفی می دهد؟
SDS یک شوینده است که دارای یک زنجیره بلند آلیفاتیک و یک گروه سولفات است. این ماده شوینده با پروتئین های دناتوره شده تعامل می کند و یک کمپلکس با بار منفی قوی تشکیل می دهد (بار منفی ناشی از SO 42 − گروه SDS). پروتئین ها ابتدا با حرارت دناتوره می شوند و سپس SDS به مقدار زیاد اضافه می شود.
